בתשובה לד''ר הושע אבינתן, 04/05/01 17:12
המשך הדיון 22477
טוב, קראתי את המאמר ב­science.
או נכון יותר רפרפתי בו. הוא מכיל המון מספרים
ובלגן שלם לגבי משפחות שונות של חלבונים
והשוואות בין המינים ובתוך המינים וכולי ובשעה הזו קצת
קשה להתעמק.
אבל לגבי כל ההשוואות האלו בעזרת המחשב-
הן אמנם טובות ועוזרות אבל הרבה פעמים הן מפספסות דברים
וזה מניסיון. מלבד זאת לפחות פעם אחת במאמר הם מודים
שהם פיספסו ­המחשב גילה שאין דמיון בין גנים אשר ידוע
כבר מלפני כן שיש דמיון ביניהם וגם תפקיד דומה
לחלבונים המקודדים על ידם
(זה תפס את עיני מפני שמדובר במשפחת ה­BCL-2 אשר אני
עובד עליה במעבדה)
שוב, ישנם גנים אשר בעלי תפקיד דומה אבל כל
הדמיון ביניהם מסתכם ברצף של עשר חומצות אמינו או אף
פחות מכך ­ מספר חומצות אמינו המסודרות בסדר מסויים
על פני החלבון.

נקודה נוספת ­ החוקרים לא התייחסו בכלל לשחבור חלופי
כך שיכול להיות שהם פספסו די הרבה לדוגמה בהשוואות בין דומיינים שונים

לגבי ההבדל בין שני מיני זבובי הדרוזופילה­
ראשית הם אומרים בירור במאמר שאלו מינים רחוקים distantly related
במילים שלהם, רק שמבחינת מורפולוגית והתפתחותית הם נראים דומים
הם לא מייחסים לזה במאמר אבל צריך לזכור שהגדרות המינים
נעשו ברובן עוד לפני הגנטיקה בכלל והמולקולרית בפרט
רק על סמך מורפולוגיה.
שוב הם לא יודעים האם השלושים אחוז של החלבונים שאין ביניהם
כביכול רצף משותף הם בעלי תפקידים ו­או מבנים דומים
אשר יובילו למורפולוגיה דומה
דבר נוסף ­ למה לא מראים השוואה בין עוד מינים של דרוזופילה?
האם ההבדל של שלושים אחוז נכון לגבי כל המינים או רק שני אלו?
ועוד משהו ­ ההשוואה נעשתה על סמך ניסוי היברידיזציה של
cDNA. האם לא ייתכנו בעיות טכניות שגרמו להבדל?
האם יש ביקורת חיובית שמראה לגבי מינים מסויימים הבדלים קטנים יותר?
טוב­ הלכתי למאמר המקורי עליו מבוסס הנתון של הבדל של שלושים אחוז
אז ככה ­הם לקחו ספרייה של מאה cDNAs בלבד בשביל ההשוואה
מתוכם שישים אחוז היו של גנים לא ידועים ולכן הם לא יכולים להיות
בטוחים שאכן כל ה­cDNAs הם נכונים או שלמים.
שני הזנים של הדרוזופילה נפרדו לפני כארבעים עד שישים מיליון שנה
זה הרבה זמן לצבור הבדלים
אין להם ביקורת חיובית (למשל השוואה בין שני מינים קרובים אחרים
של חרקים)
הם כן משווים למין אחר של דרוזופילה אבל הם לקחו רק 11 cDNAs-
אחד מהם של גן שמור והאחרים של גנים בהם לא מצאו דמיון בין שני
המינים הראשונים
דבר שלישי ­ גם הם טוענים שצריך לראות את המבנה המרחבי של החלבונים
כדי לדעת האם הם שונים גם במבנה ולא רק ברצף

ונחזור חמאמר בסיינס­
אמנם זה מאוד נחמד ההשוואה בין שלושה מינים משלוש מחלקות
שונות אבל מי אמר שאלו הם מינים מייצגים?
אני בטוח שאם תקח למשל את השמר S. pombe תגלה שיש דמיון רצף יותר
גדול בינו לזבוב מאשר של הסכרומיצס סרוויסיה
מנגנון חלוקת התא למשל בפומבה דומה לזה של יונקים יותר
מאשר זה של סרוויסיה

הייתי רוצה לראות השוואה בין בוא נאמר לפחות חמישה
מינים שונים מכל מחלקה
עדיף גם שהמינים שייבחרו מכל מחלקה יהיו ממשפחות או לפחות סוגים שונים

אז זאת ההתייחסות שלי למאמר לאחר קריאה שטחית שלו

עכשיו אני צריך לחזור לניסוי אז אני אענה על השאר אחר כך
המשך הדיון 22536
אני מקבל את הבקורת שלך על המאמר בscience עכ"פ זה נושא ראוי לחקירה מעמיקה, ואם יתברר שאכן הבדלי הגנים בין המינים כל כך גדולים יה-ה בכך טעון נגד רעיון האבולוציה.

חזרה לעמוד הראשי המאמר המלא

מערכת האייל הקורא אינה אחראית לתוכן תגובות שנכתבו בידי קוראים