בתשובה לערן בילינסקי, 23/04/05 0:25
עכברים 295325
מהמעט שאני מכיר (ואני לא גנטיקאי) אז ההשוואה נעשית בדרך כלל על דמיון באזורים עם תפקוד ידוע לדוגמה אזורים שמקודדים לחלבונים, לאלמנטים רגולטורים של RNA ואזורי בקרה ב DNA.
המספרים השרירותיים של הדמיון יכולים להטעות כי המספר בפני עצמו לא אומר הרבה. מה שקובע זה איפה נמצא ההבדל. הגישה הרווחת היום היא שהרוב השוני בין האורגניזמים השונים טמון בבקרת ההתבטאות של הגנים. גם שוני קטן ב DNA יכול להביא לשוני גדול במופע, לא חייבים לשנות הרבה.

חידה, אם הטקסט כתוב בשפה של ארבע אותיות בלבד, מה אחוז השוני הצפוי בין שני רצפים רנדומלים באורך n?
שאלת תם 295339
מה זה "בקרת ההתבטאות של הגנים"?
שאלת תם 295377
גן יכול להיות קיים ב DNA, ו
1. לא להתבטא כלל
2. להתבטא קצת
3. להתבטא רגיל
4. להתבטא המון.
אם נלביש את המודל בשורה הקודמת על הגן לשעירות נקבל ארבעה יצורים שונים בתכלית:
1. דוגמנית (ולא שאני אוהב נשים חלקות לחלוטין, אבל זה מה שהצו האופני אומר)
2. בחורה
3. בחור
4. קוף

בקרת התבטאות של גנים קיימת לאורך כל הדרך. ברמת ה DNA מדובר ברצפים הסמוכים לגן שמאפשרים קשירה של קומפלקס השיעתוק ברמה גבוהה/בינונית/נמוכה, מודיפקציות על ה DNA עצמו כמו הוספת קבוצות מתיל שמשפיעות על התבטאות הגן. ברמת ה RNA מדובר באורך חיי ה RNA ומספר מולקולות החלבון המתורגמות מכל מולקולת RNA (ויש לכך מגוון מכנזימים אבל בשביל לדעת עליהם תצטרך לשאול כבר מישהו שיודע על זה יותר ממני), ברמת החלבון מדובר בשפעול, השתקה (זירחון, גיפור, ד-זירחון, ד-גיפור, ADP ריבוזילציה ועוד מנגנונים), אורך חיי החלבון (פרוק עם יוביקיטין) ועוד ועוד ...

בטוח יש עוד מנגנונים שאני לא יודע וכאלו ששכחתי, אבל אני מקווה שהרעיון ברור.
שאלת תם 295433
אם כבר מדברים על רמת השעירוּת, מתי יפותח הטיפול הביולוגי למניעת שיער גוף? ומה הוא יכלול?
הרי ידוע כי לחלק מאוכלוסיית אסיה הרחוקה יש שיער גוף דליל עד בלתי קיים, והשוק מרויח (או אנשים פרטיים- ע"ע רונית רפאל) מרמת שעירוּת האוכלוסיה
שאלת תם 295445
הפתרון יכול היות, כמובן, שיבוא איזה יזם זריז ויעביר גנים של שעירות הגוף לשעירות ראש לקרחים ולהיפך.
מצב מעניין יותר 295450
יווצר אם אותו יזם יחליט שזכויות היוצרים על הגנים נשארות שלו, ואין סיבה להעביר אותם לדורות הבאים (גם אם הוא הדביק את תאי המין) בלי תשלום הוגן. אז כמו יצרני זרעים מסויימים, הוא יצור גנים שעובדים רק דור אחד (נוצרו זרעים מהונדסים המצמיחים צמחים עקרים, על כך נמתחה ביקורת רבה) וכעת עבור הזכות לקבל ילדים שעירים במידה הגיונית (כי אפשר לקחת את ההרס העצמי לקיצוניות) או ילדים בכלל, נא לגשת לבנק הקרוב ...
מצב מעניין יותר 295506
עניין ההרס העצמי לא נראה לי קשור הנה כלל. לעומת זאת, אם היו מהנדסים את הגנים כך שארוכות הצואר יוכלו להיות כאלה בלי כל המחרוזות המכבידות, וקטנות-כף הרגל ימשיכו בצורתן זו גם בלי בעינויים שבנעליים סדומיות לחלוטין - זה כבר סיפור אחר...
שאלת תם 295517
הבעיה קשה יותר ממה שנראה על פני השטח.

מדענים עמלים למפות את הגנום האנושי כדי למנוע מחלות, אך סביר שהכסף הגדול יגיע מהתאמת העוברים שלא נולדו לאידיאל היופי של ההורים: חזה גדול (או קטן), לא שעיר מדי, גבוה ובלונדיני.

לדעתי עדיף לתת לרונית רפאל להרוויח את לחמה ולמדענים למנוע טיי-זקס.
עכברים 295833
נתחיל בחידה. בהנחה שבודקים התאמות של של אות לאות המקבילה לה (באותו אינדקס מקום), אז יש סיכוי של 25% ששתי האותיות האקראיות זהות, ולכן אחוז השוני הצפוי הוא בממוצע 75% מהרצף ללא תלות ב-n. אורך הטקסט קובע רק את הוואריאנס (חוק המספרים הגדולים).

עפ"י ההגדרה הזו לשוני בין רצפים, הרצף GATTACAT והרצף TGATTACA הם בעלי 12.5% זהות. אבל אפשר לראות שהם זהים עד-כדי הזזה, כלומר בעלי 87.5% זהות (שבע מתוך שמונה אותיות). לכן הגדרה של אחוז שוני עפ"י התאמת האותיות אחת לאחת לא מתאימה.
לכן (אאל"ט) בבדיקת אחוז רצפים חוזרים בין שתי דגימות DNA, מחפשים התאמות בין הרצפים השונים ומודדים את אחוז הרצפים בעלי התאמות מתוך כלל רצפי ה-DNA.

ואם נחזור לחידה, במקרה הזה הפתרון תלוי באורך הנדרש לקביעת "התאמה" של שתי תת-מחרוזות, ובכללים לכך (למשל מונוטוניות של סדר תת-המחרוזות).

חזרה לעמוד הראשי המאמר המלא

מערכת האייל הקורא אינה אחראית לתוכן תגובות שנכתבו בידי קוראים